Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms