Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms