Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCATO75600 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCATO75600 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCATO75600 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCATO75600 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCATO75600 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms