Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCBO75439 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms