Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCC9O60706 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC44■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms