Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD5O60279 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD5O60279 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD5O60279 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD5O60279 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SUSD5O60279 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms