Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms