Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms