Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms