Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRXO43186 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRXO43186 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRXO43186 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRXO43186 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRXO43186 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRXO43186 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRXO43186 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRXO43186 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRXO43186 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRXO43186 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms