Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6AO15550 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM6AO15550 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms