Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN2DO15399 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2DO15399 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms