Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
APAF1O14727 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
APAF1O14727 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APAF1O14727 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APAF1O14727 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APAF1O14727 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APAF1O14727 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APAF1O14727 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APAF1O14727 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APAF1O14727 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APAF1O14727 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
APAF1O14727 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APAF1O14727 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APAF1O14727 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APAF1O14727 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APAF1O14727 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APAF1O14727 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APAF1O14727 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APAF1O14727 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
APAF1O14727 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APAF1O14727 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APAF1O14727 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
APAF1O14727 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APAF1O14727 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APAF1O14727 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APAF1O14727 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APAF1O14727 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APAF1O14727 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APAF1O14727 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APAF1O14727 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms