Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CUX2O14529 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CUX2O14529 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CUX2O14529 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CUX2O14529 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CUX2O14529 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CUX2O14529 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CUX2O14529 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CUX2O14529 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CUX2O14529 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CUX2O14529 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CUX2O14529 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CUX2O14529 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CUX2O14529 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CUX2O14529 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CUX2O14529 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CUX2O14529 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CUX2O14529 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CUX2O14529 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CUX2O14529 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CUX2O14529 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CUX2O14529 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CUX2O14529 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CUX2O14529 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CUX2O14529 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CUX2O14529 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CUX2O14529 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CUX2O14529 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUX2O14529 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CUX2O14529 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CUX2O14529 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CUX2O14529 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms