Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3BRM9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3BRM9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3BRM9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3BRM9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BRM9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BRM9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BRM9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms