Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms