Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISM1B1AKI9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ISM1B1AKI9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms