Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf51A6NDU8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms