Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD3A2A2Y4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms