Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
UBA6A0AVT1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBA6A0AVT1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms