Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
E2F8A0AVK6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms