Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 UGT1A4-201ENST00000373409 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 ANGEL1-205ENST00000557179 1427 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 LMCD1-202ENST00000397386 1501 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 TYRO3P-201ENST00000558165 2705 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 LAMP5-201ENST00000246070 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 CASS4-201ENST00000360314 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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