Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IRF5-203ENST00000402030 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 STRADA-247ENST00000640679 1816 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ST13-201ENST00000216218 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLK4-211ENST00000515069 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GAPDHP67-201ENST00000422905 788 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 STX17-AS1-201ENST00000529965 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HPSE2-203ENST00000370552 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLUT-201ENST00000499662 2518 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CRNN-201ENST00000271835 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SLC22A8-203ENST00000430500 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AGBL2-203ENST00000525123 3577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 POLDIP3-201ENST00000252115 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LGR5-203ENST00000540815 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF223-201ENST00000434772 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NR2F2-203ENST00000421109 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ATF3-211ENST00000613954 2031 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SGK3-202ENST00000396596 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PTPN20-204ENST00000374346 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SPATA41-202ENST00000560282 2072 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CENPO-201ENST00000260662 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IGSF9B-201ENST00000321016 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LINC00355-201ENST00000456627 1878 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ASAP3-209ENST00000495646 2552 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PPFIBP2-208ENST00000528883 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MPP2-201ENST00000269095 4414 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SH2D4B-201ENST00000313455 2889 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RFFL-205ENST00000415395 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MOV10L1-210ENST00000545383 3889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IQANK1-203ENST00000533004 2737 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF181-201ENST00000392232 2791 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MX2-201ENST00000330714 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RASGRP4-208ENST00000587753 3011 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IL4R-203ENST00000543915 3539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SNAP25-201ENST00000254976 2053 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms