Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 UGT1A4-201ENST00000373409 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 HYDIN-209ENST00000538248 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 GLDN-210ENST00000612989 1676 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 MRPL24-201ENST00000361531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AL139807.1-201ENST00000500636 704 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 GSKIP-203ENST00000554182 760 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC005746.1-202ENST00000585495 716 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC105020.5-201ENST00000614810 423 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 BHLHB9P1-201ENST00000553845 1651 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AL021408.2-201ENST00000624196 1544 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 HIPK1-AS1-204ENST00000450706 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC008663.2-201ENST00000517299 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NPIPB9F8W1W9 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms