Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD2APQ9Y5K6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CD2APQ9Y5K6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CD2APQ9Y5K6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD2APQ9Y5K6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD2APQ9Y5K6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD2APQ9Y5K6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms