Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB4Q9Y5E5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB4Q9Y5E5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms