Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC9Q9Y397 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC9Q9Y397 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC9Q9Y397 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms