Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP3Q9Y2W7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms