Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC5Q9UQL6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC5Q9UQL6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms