Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms