Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA8BQ9ULN7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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