Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH22Q9UJ99 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms