Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1NQ9UHG2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1NQ9UHG2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1NQ9UHG2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1NQ9UHG2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1NQ9UHG2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1NQ9UHG2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms