Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS29Q9UBQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS29Q9UBQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 448.7 ms