Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ORC3Q9UBD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms