Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms