Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD3Q9P035 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms