Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms