Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBP1Q9NZI7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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