Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS1Q9NYS0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms