Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH5Q9NX47 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms