Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLE1Q9NVX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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