Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms