Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASF1BQ9NVP2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms