Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms