Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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