Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM16Q9HAZ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms