Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms