Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL4Q9C0H6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL4Q9C0H6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms