Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM31Q9BZY9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM31Q9BZY9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM31Q9BZY9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM31Q9BZY9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms